System Genomics Lab

Genome Resources

Common Name	Scientific Name	Genome	Annotations	Transcripts	Proteins	JBrowse	Publication
Antarctic toothfish	Dissostichus mawsoni	D.mawsoni.genome.fasta.gz	D.mausoni.genome.gff3.gz	D.mawsoni.transcripts.fasta.gz	D.mawsoni.proteins.fasta.gz	JBrowse	Antarctic toothfish
Obscure pufferfish	Takifugu obscurus	T.obscurus.genome.fasta.gz	T.obscurus.genome.gff3.gz	T.obscurus.transcripts.fasta.gz	T.obscurus.proteins.fasta.gz	JBrowse	Obscure pufferfish
Scaly rockcod	Trematomus loennbergii	T.loennbergii.genome.HiC.fasta.gz	T.loennbergii.gff3.gz	T.loennbergii.transcripts.fasta.gz	T.loennbergii.proteins.fasta.gz	JBrowse	Scaly rockcod
Southern elephant seal	Mirounga leonine	M.leonine.genome.fasta.gz	M.leonine.gff3.gz	M.leonine.transcripts.fasta.gz	M.leonine.proteins.fasta.gz	JBrowse	Southern elephant seal
Korean Common Octopus	Octopus minor	O.minor.genome.fasta.gz	O.minor.gff3.gz	O.minor.transcripts.fasta.gz	O.minor.proteins.fasta.gz	JBrowse	Octopus minor
Antarctic copepod	Tigriopus kingsejongensis	T.k.genome.fasta.gz	T.k.gff3.gz	T.k.transcripts.fasta.gz	T.k.proteins.fasta.gz	JBrowse	Antarctic copepod
Antarctic dragonfishes	Parachaenichthys charcoti	P.charcoti.genome.fasta.gz	P.charcoti.gff3.gz	P.charcoti.transcripts.fasta.gz	P.charcoti.proteins.fasta.gz	JBrowse	Antarctic dragonfishes
Southern giant petrel	Macronectes giganteus	Mgig.genome.fasta.gz	Mgig.gff3.gz	Mgig.transcripts.fasta.gz	Mgig.proteins.fasta.gz	JBrowse	Southern giant petrel
Blackfin Icefish	Chaenocephalus aceratuss	CA.genome.fasta.gz	CA.gff3.gz	CA.transcripts.fasta.gz	CA.proteins.fasta.gz	JBrowse
Boreal Cup Lichen	Cladonia borealis	Cbo.genome.fasta.gz	Cbo.genome.gff3.gz	Cbo.transcripts.fasta.gz	Cbo.protein.fasta.gz	JBrowse
Lichen	Cladonia metacorallifera	Cme.genome.fasta.gz	Cme.genome.gff3.gz	Cme.transcripts.fasta.gz	Cme.proteins.fasta.gz	JBrowse
Lichen	050706	50706.genome.fasta.gz	50706.genome.gff3.gz	50706.final.transcripts.fasta.gz	50706.final.protein.fasta.gz	JBrowse
Lichen	050646	50646.genome.fasta.gz	50646.genome.gff3.gz	50646.final.transcripts.fasta.gz	50646.final.protein.fasta.gz	JBrowse
Lichen	ARCT09032	ARCT09032.genome.fasta.gz	ARCT09032.genome.gff3.gz	ARCT09032.final.transcripts.fasta.gz	ARCT09032.final.protein.fasta.gz	JBrowse
Lichen	ANT050747	ANT050747.genome.fasta.gz	ANT050747.genome.gff3.gz	ANT050747.final.transcripts.fasta.gz	ANT050747.final.protein.fasta.gz	JBrowse
Korea	Wando	WA1_1.fastq.gz WA1_2.fastq.gz
Korea	Wando	WA2_1.fastq.gz WA2_2.fastq.gz
Korea	Wando	WA3_1.fastq.gz WA3_2.fastq.gz
Korea	Wando	WA4_1.fastq.gz WA4_2.fastq.gz
Korea	Wando	WA5_1.fastq.gz WA5_2.fastq.gz
China	Lidao Bay	LB1_1.fastq.gz LB1_2.fastq.gz
China	Lidao Bay	LB2_1.fastq.gz LB2_2.fastq.gz
China	Lidao Bay	LB3_1.fastq.gz LB3_2.fastq.gz
China	Lidao Bay	LB4_1.fastq.gz LB4_2.fastq.gz
China	Ailian Bay	AB1_1.fastq.gz AB1_2.fastq.gz
China	Ailian Bay	AB2_1.fastq.gz AB2_2.fastq.gz
China	Ailian Bay	AB3_1.fastq.gz AB3_2.fastq.gz
China	Ailian Bay	AB4_1.fastq.gz AB4_2.fastq.gz
China	Ailian Bay	AB5_1.fastq.gz AB5_2.fastq.gz

---